学院立足安徽省区域发展重大战略和需求，紧贴农业发展方式向提质增效、绿色增产新转变，按照节肥、节水、节约和环境友好发展方向，瞄准新型肥料研发、互联网+精准施肥、农产品质量安全、农村环境治理、农田生态保育、环境污染修复等关键科学与技术问题，整合资源、搭建平台、组建团队、融入产业。现有安徽省“115”产业创新团队2个，安徽省引进高校人才领军团队和科研平台创新团队各1个，组建了农产品质量安全、农业环境污染控制与生态修复、环境监测与评价、农业固体废弃物处理与资源化利用、水污染控制与水环境治理、土壤质量提升与农业污染防控、植物营养与新型肥料、地理信息与农业防灾减灾等8个科研创新团队。近四年来，承担 “973”、“863”计划、国家科技支撑计划、国家重点研发计划、国家自然科学基金等国家级项目40余项，省级项目30余项，成果转化与产学研合作等横向项目200多项，年均到账经费约2000万元，主持获得省部级以上科技奖励4项，发表论文300余篇，其中SCI论文90余篇，制定国家和行业标准23项，授权发明专利15项，软件著作权20余项。