本学科始于 20 世纪 60 年代农业与林业生态学，2003 年本科招生，同年获生态学一级硕士点，2011 年获一级学科博士点，2020 年获省高峰学科建设。现有安徽大别山森林生态系统国家定位观测研究站、农田生态保育与污染防控安徽省重点实验室等省部级教科研平台10个。秉承生态文明思想，围绕安徽区域农业绿色生产技术亟待解决的难题，强化关键技术体系构建和应用，形成 4 个研究方向。

1.植物生态学

围绕“生态因子-植物-土壤生物”系统开展研究。阐释了植物功能性状对植被 演替的响应；探究了外来植物对入侵地土壤生物区系的影响和入侵植物的生态控制策略，构建了都市农区景观植物生态修复技术体系。

2.修复生态学

围绕重金属、农药等污染物的迁移转化与修复技术开展研究。揭示了污染物转运规律和降解特征；研发出有机物污染修复的微生物菌/酶制剂 14 个；构建了土壤重金属稳定钝化、植物-微生物联合修复技术体系。

3.生态系统生态学

围绕生态系统中养分循坏、氮磷流失、碳氮循环开展研究。揭示了秸秆还田对土壤有机质化学结构、氮沉降对土壤微生物及有机碳的影响机制，构建秸秆还田快腐与氮磷高效利用关键技术，集成农田面源污染生态防控技术体系。

4.农业生态学

围绕粮食安全、农牧循环开展研究。构建区域麦玉和稻麦两熟避灾抗逆模式，探索作物抗逆生理生态机制，揭示农业废弃物资源化利用对土壤氮素转化及微生物类群结构影响机理，集成高效农牧耦合生态模式。